我国构建世界首个西红柿超泛基因组

　　#我国构建世界首个西红柿超泛基因组#

　　科技日报讯(通讯员许娟 赵月 李宁 记者朱彤)由新疆农科院加工西红柿生物育种立异团队牵头，联合中国农业科学院、新疆大学、新疆农业大学等多家单位，成功构建了世界首个西红柿超泛基因组。4月6日，相关科研成果以《超泛基因组研讨提醒野生和培养西红柿物种基因组和结构变异多样性》为题在线发表于世界学术期刊《天然·遗传》。

　　西红柿(Solanum lycopersicum L.)是果实遗传、发育和生理研讨的经典模型体系，也是全球出产中最重要的蔬菜作物。因为人们为寻求更大的果实和更高的产值，对培养西红柿进行密布人工挑选，致使现在西红柿遗传多样性大幅损失，改进进程存在严峻瓶颈。相比之下，野生西红柿在各生态环境下表现出广泛的遗传和表型多样性，其丰厚的等位基因变异、更强的耐生物钳制和非生物钳制性、高水平的可溶性固体含量、西红柿红素和风味化合物以及高分枝才能对现代育种具有重要意义。

　　该团队研讨收集了8个野生西红柿种、1个西红柿近源野生种和2个培养西红柿代表性种类，使用PacBio(第三代单分子实时测序技能)、Bionano(全基因组光学图谱技能)和Hi-C(高通量染色体构象捕获技能)测序技能，组装了11个染色体水平高质量基因组，解析了西红柿属基因组特征，重构了西红柿属体系发生关系，构建了世界首个西红柿超泛基因组，为集体水平SV基因分型供给了强壮的渠道，这将有助于开发风味改进西红柿种类的育种符号。

　　该团队使用超泛基因组，在野生西红柿资源中克隆到一个能明显添加分枝数且果实数量添加67.1%的新基因，对往后加工西红柿种类立异具有严重价值，也为其他农作物展开生物育种根底前沿研讨供给了新思路，为加速新种类选育进程拓荒了新方向。

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